清华大学2012年本科招生专业及分流方向如下：
| 招生专业名称 | 分流专业或方向 | 所属院系 | 考生类别 |
| 建筑学 | 建筑学 | 建筑学院 | 限理工类考生 |
| 建筑环境与设备工程 | 建筑环境与设备工程 | ||
| 土木工程 | 土木工程 | 土水学院土木工程系 | |
| 工程管理 | 土水学院建设管理系 | ||
| 水利水电工程 | 水利水电工程 | 土水学院水利系 | |
| 机械工程及自动化（机械系） | 机械工程及自动化 | 机械学院机械系 | |
| 机械工程及自动化（精仪系） | 机械工程及自动化 | 机械学院精仪系 | |
| 测控技术与仪器 | 测控技术与仪器 | ||
| 工业工程 | 工业工程 | 机械学院工业工程系 | 限理工类英语考生 |
| 能源动力系统及自动化 | 能源动力系统及自动化 | 机械学院热能系 | 限理工类考生 |
| 车辆工程 | 车辆工程 | 机械学院汽车系 | |
| 汽车车型与车身设计 | |||
| 工程力学与航天航空工程 | 航空宇航工程 | 航天航空学院 | |
| 工程力学 | |||
| 热能与动力工程（工程热物理） | |||
| 工程力学（钱学森力学班） | 进入专业课学习期间，根据双向选择原则，多向选择专业。 | ||
| 工程力学与航天航空工程（飞行员班） | 由清华大学与空军联合培养，前3年在清华大学学习，第4年在空军航空大学学习，对完成联合培养本科4年学习要求并毕业的飞行学员，两校同时颁发学历、学位证书。 | ||
| 电子信息科学类 | 电子信息科学与技术 | 信息学院电子系 | |
| 微电子学 | 信息学院微纳电子系 | ||
| 计算机科学与技术 | 计算机科学与技术 | 信息学院计算机系 | |
| 自动化 | 自动化 | 信息学院自动化系 |
