| 计算机软件 | 计算机软件 | 信息学院软件学院 | 限理工类英语考生 |
| 计算机科学与技术（计算机科学实验班） | 计算机科学与技术（计算机科学实验班） | 交叉信息研究院 | 限理工类考生 |
| 电气工程及自动化 | 电气工程及自动化 | 电机工程与应用电子技术系 | |
| 环境工程 | 环境工程 | 环境学院 | |
| 给排水科学与工程 | |||
| 工程物理 | 工程物理 | 工程物理系 | 既招收普通生也招收面向国防科研单位的定向生 |
| 工程物理（能源实验班） | 进入专业课学习期间，根据双向选择原则，可选择不同能源领域专业方向。 | 限理工类考生 | |
| 核工程与核技术 | 核工程与核技术 | 仅招收定向生 | |
| 化学工程与工业生物工程 | 化学工程与工业生物工程 | 化学工程系 | 限理工类考生 |
| 高分子材料与工程 | 高分子材料与工程 | ||
| 材料科学与工程 | 材料科学与工程 | 材料科学与工程系 | |
| 生物医学工程 | 生物医学工程 | 生物医学工程系 | |
| 临床医学（医学药学实验班） | 医学、药学 | 医学院 | 限理工类英语
考生 |
| 药学（医学药学实验班） | |||
| 临床医学 | 临床医学 | 北京协和医学院（清华大学医学部） | |
| 数学与应用数学 | 基础数学、应用数学、概率统计、计算数学、运筹学与控制论 | 理学院数学系 | 限理工类考生
|
| 物理学 | 物理学、应用物理 | 理学院物理系 | |
| 数理基础科学 | 学生从三年级开始进入科学实践专题研究（Seminar），可选择参加不同学科方向的科研实践。 | 限理工类考生，仅招收保送生和面向校内新生招生 | |
| 化学 | 化学、化学生物学 | 理学院化学系 | 限理工类考生 |
| 化学生物学（化生基础科学班） | 化学、生物学及其相关学科 | 理学院 | 限理工类考生，仅招收保送生和面向校内新生招生 |
| 生物科学 | 生物科学、生物技术 | 生命科学学院 | 限理工类英语考生 |
