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HBase怎么从Hadoop读取数据,DFSInputStream

2012-09-20 
HBase如何从Hadoop读取数据,DFSInputStreamHDFS Client的读取流是从DFSInputStream来获得的,外层做了不少

HBase如何从Hadoop读取数据,DFSInputStream

HDFS Client的读取流是从DFSInputStream来获得的,外层做了不少包装。

从DFSInputStream读取数据有两种方式:

(1)seek(long targetPos) +?read(byte buf[], int off, int len)

(2)read(long position, byte[] buffer, int offset, int length)

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第一种适合顺序读取,比如hbase里面的scan请求或者hbase的compact读取。读取的数据量一般都比较大,所以打开预读可以减少磁盘的iops,预读可以见hdfs相关的jira

Add HDFS support for fadvise readahead and drop-behind

https://issues.apache.org/jira/browse/HDFS-2465

Enable fadvise readahead by default?

https://issues.apache.org/jira/browse/HDFS-3697

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第二种是随机读取,适合读取少量的数据,比如hbase里面的get请求

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这两种读取还有一些不同的地方:

同一个DFSInputStream可以有多个应用程序在使用,但是需要注意下面:

(1)同一个时候只能有一个应用程序在执行seek(long targetPos) +?read(byte buf[], int off, int len)?

(2)在一个应用程序执行seek(long targetPos) +?read(byte buf[], int off, int len) 时,其他应用程序使用这个DFSInputStream执行read(long position, byte[] buffer, int offset, int length),并且同一时间可以有多个应用程序使用这个DFSInputStream执行read(long position, byte[] buffer, int offset, int length)

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TestCase可以见hdfs的org.apache.hadoop.hdfs.TestPread

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我们看下hbase是如何来使用的:

pread为true代表随机读取,当请求是get请求时会设置pread为true

0.90.x版本:

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BoundedRangeFileInputStream
  @Override  public int read(byte[] b, int off, int len) throws IOException {    if ((off | len | (off + len) | (b.length - (off + len))) < 0) {      throw new IndexOutOfBoundsException();    }    int n = (int) Math.min(Integer.MAX_VALUE, Math.min(len, (end - pos)));    if (n == 0) return -1;    int ret = 0;    if (this.pread) { // 随机读取,第二种方式,可以任意多应用程序同时调用      ret = in.read(pos, b, off, n);    } else {      synchronized (in) { //顺序读取,第一种方式,同一个时候只能有一个应用程序调用,所以这个地方加了锁        in.seek(pos);        ret = in.read(b, off, n);      }    }    if (ret < 0) {      end = pos;      return -1;    }    pos += ret;    return ret;  }

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0.94.x版本:

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HFileBlock    protected int readAtOffset(FSDataInputStream istream,        byte[] dest, int destOffset, int size,        boolean peekIntoNextBlock, long fileOffset, boolean pread)        throws IOException {      if (peekIntoNextBlock &&          destOffset + size + hdrSize > dest.length) {        // We are asked to read the next block's header as well, but there is        // not enough room in the array.        throw new IOException("Attempted to read " + size + " bytes and " +            hdrSize + " bytes of next header into a " + dest.length +            "-byte array at offset " + destOffset);      }      if (pread) {        // Positional read. Better for random reads.        int extraSize = peekIntoNextBlock ? hdrSize : 0;        int ret = istream.read(fileOffset, dest, destOffset, size + extraSize);  // 随机读取,第二种方式,可以任意多应用程序同时调用        if (ret < size) {          throw new IOException("Positional read of " + size + " bytes " +              "failed at offset " + fileOffset + " (returned " + ret + ")");        }        if (ret == size || ret < size + extraSize) {          // Could not read the next block's header, or did not try.          return -1;        }      } else {        // Seek + read. Better for scanning.        synchronized (istream) { //顺序读取,第一种方式,同一个时候只能有一个应用程序调用,所以这个地方加了锁          istream.seek(fileOffset);          long realOffset = istream.getPos();          if (realOffset != fileOffset) {            throw new IOException("Tried to seek to " + fileOffset + " to "                + "read " + size + " bytes, but pos=" + realOffset                + " after seek");          }          if (!peekIntoNextBlock) {            IOUtils.readFully(istream, dest, destOffset, size);            return -1;          }          // Try to read the next block header.          if (!readWithExtra(istream, dest, destOffset, size, hdrSize))            return -1;        }      }      assert peekIntoNextBlock;      return Bytes.toInt(dest, destOffset + size + BlockType.MAGIC_LENGTH) +          hdrSize;    }

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为什么随机读取的时候可以任意多个应用程序使用呢:

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(1)seek(long targetPos) +?read(byte buf[], int off, int len)?

第一种,seek很简单改变下pos,read(byte buf[], int off, int len) 里面:重要的是blockSeekTo(long target) ,blockSeekTo第一步做的操作就是看下当前blockReader是否为null,如果不为null那么就close这个BlockReader,

然后new一个BlockReader,向DataNode发送的请求里面包含当前开始读取的位置,以及长度(blk.getNumBytes() - offsetIntoBlock来获得,也就是说长度是当前块剩余可读的数据量),?read(byte buf[], int off, int len) 可以多次调用,直到数据已经读完。在这里我们可以看到new 了一个BlockReader后,没有及时关闭,BlockReader关闭的时机是下次调用seek+read时发现上次new 的BlockReader还在,那么就关闭。 所以如果一个应用程序在调用一个DFSInputStream流的seek+read时,如果另外一个应用执行seek+read的话,后面这个应用程序会把前面那个应用程序的BlockReader关闭,导致前面一个应用程序读取不到数据了,所以同一时间只能有一个应用程序调用一个DFSInputStream流的seek+read,除非使用另外一个DFSInputStream流的seek+read

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(2)read(long position, byte[] buffer, int offset, int length)

第二种,读取时每次都会new一个BlockReader,向DataNode发送的请求里面包含了读取开始的位置(position),以及长度length,读取完后就会close这个BlockReader

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pread Use positional read instead of seek+read (positional is?better doing random reads whereas seek+read is better scanning).

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?https://issues.apache.org/jira/browse/HBASE-2180

?/proc/sys/net/ipv4/tcp_tw_recycle

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