在实际运用的过程中，阴阳五行学说，常常是相互联系，不可分割的。也就是说，论阴阳则往往联系到五行，言五行又常常离不开阴阳。如在论述脏腑功能时，概括地说，脏为阴，腑为阳。但在分析每一脏腑具体功能时，除某一脏腑本身都有其不同的阴阳外，由于脏腑之间均存在着五行生克的关系，所以，任何一脏腑的阴或阳的变化，就必然会涉及到与之有关的其他脏腑的阴或阳的变化。如肾阴虚常引起肝阳亢，就有五行生克乘侮的关系。阴阳五行学说的结合，不仅可以说明事物矛盾双方的一般关系，而且可以说明事物间相互联系、相互制约的较为具体和复杂的关系，从而有利于解释复杂的生命现象和病理过程。
