相邻的鳃弓之间有浅沟,在体表侧者称鳃沟(branchial groove);与之相对应的鳃弓的内侧是原始咽部,其表面衬覆的内胚层上皮向侧方增生呈囊样,形成与鳃沟相对应的浅沟,称咽囊(pharyngeal pouch)。第1鳃沟在发育中加深形成外耳道、耳丘、耳廓,在沟的底部,表面的外胚层与邻近的中胚层和第1咽囊的内胚层一起形成鼓膜。与之对应的第1咽囊形成中耳鼓室和咽鼓管。