塔里木大学现有10个学院(植物科学学院、动物科学学院、生命科学学院、水利与建筑工程学院、信息工程学院、机械与电气化工程学院、人文学院、经济与管理学院、高等职业技术学院、成人教育学院)，1个省部共建国家重点实验室培育基地、1个省级重点实验室、34个校级实验室，设有新疆南疆区域科技创新基地、西域文化研究所、非传统安全与边疆民族发展研究中心、环塔里木经济研究中心、棉花研究所、园艺研究所、食用菌研究所、南疆畜禽疫病诊断中心等研究机构。学校现有4个一级硕士学位点，19个二级硕士专业学位点，1个专业硕士学位点，40个本科专业，涉及7大学科门类，4个国家级特色专业建设点，2个省级实验教学示范中心、1个省级教学团队、13门省级精品课程、50门重点建设课程、80多个校内外教学实习基地。
