朱清时：前五年最多招2000人
南科大创校校长朱清时接受记者采访时表示，南科大已成为合法的高教机构，可以进行希望进行的改革。他也强调，8000人是学校最终的长远目标，其中还应该包括研究生的数量。按照预先的设计，“学校在前五年的招生最多为2000人”，因为“我们希望南科大能办成精品，当师资队伍、设备和研究基地没有配套之前，我们不会大规模招生”。今年的招生规划将报请有关教育主管部门批准，尚未确定。
2011年6月，南方科技大学首批入学的45名学生全部放弃高考，一度引起各界高度关注。在该校公布的管理暂行办法中，“教授治学、学术自治”原则被写入总则。