河道治理中，文物保护始终是一个重要的课题。浙扛省有悠久的历史文化，有些河道沿岸文物古迹众多，整治中，应通过开发、保护，挖掘这些古迹的内涵韵味，恢复古迹，并将其融合到工程之中，设计成风格各异，却又与周边环境融为一体，形成一处一景。如绍兴市正在进行的对具有1700多年历史的古运河的整治，从整条古运河文化特色考虑，运河之间布置了纤道石塘、缘木古渡、贺循塑像、浪桨风帆等内容。通过对古纤道等景观遗迹的保护开发与运河环境的综合治理，在提高河道防洪能力的同时，再现了绍兴古运河悠久历史文化，把古运河建成碧水长河、生态绿园、文化走廊，充分显示江南水乡、历史名城的无限风光。
4.污染源的控制处理与水体改善
(1)截污治污，加强管理
河道整治是个系统工程，需要水利、环保、城建、规划、土地管理、航运、园林等多个部门的协作。在河网水质严重污染的地区，必须控制点源污染、减少面源污染、治理内源污染，针对实际情况，采取截污和改善河网水质的综合措施。对于城镇村集居地要加快生活污水收集管网建设，将沿河两岸的企业单位及居民区的排放污水纳入污水管线内，同时提高居民的素质，规范生活垃圾收集处理，改变人们将垃圾往河道倾倒的陋习。
(2)水体置换，吐旧纳新
通过河道清淤、水面保洁、控制排污等工程措施，削减进入河道的污染物总量，防止河网水体的恶化，但要从根本上提高水资源的承载能力，逐步改善水体质量，还需采取水体置换、引水配水工程，使水体流动起来，变“死水”为活水，并充分利用现有河道的滩地、水面(湿地)，保护河道水生态环境，提高河流水体自净能力，达到吐旧纳新、流水不腐的效果。杭州市为了彻底改善西湖水质，实施控制上游环境和引水工程等措施，开展了西湖西进工程。由于湖西人口密集，水体保护受到威胁，采取疏散人口和建筑密度，完善基础设施，治理污染源，阻止污水进入溪流再流往西湖，新开挖水域千亩，将原先分散的水面互相贯通，并完善西湖引水设施等措施，使现在一年换2次水，达到每年换12次，基本解决丁西湖的水质污染问题。
(3)用生态方法解决生态问题
通过采取疏浚、截污和引水等工程措施后，湖泊中的富营养化、湖水浑浊、透明度难以提高这些问题就摆在我们面前，西湖就是一个典型例子。50年前，西湖湖底水草丛生，水质清澈见底，之后西湖进行了大规模疏浚，水生维管束植物大面积灭绝，水生生态系统遭到破坏，湖泊从草型转变为藻型，浮游植物控制整个水生生态系统。因此，对湖泊的富营养化问题还应采用生态方法解决。湖泊的水生生态修复是利用生态学方法进行湖泊污染治理，利用各营养生物种群间的生态关系，控制(增加、减少或引入)某些种群，改善水生生态系统的结构和功能，调节水生生态系统的平衡。通过种植一定面积的高等水生植物，如美人蕉、旱伞草、万寿菊等，在水陆交错带，配备其他的水生植物群落，包括湿生植物、挺水植物(如芦苇)、浮水植物等，可以去除水体中的营养物，使水质得到改善，水体透明度提高，水生动植物多样性得到自然恢复，使富营养湖泊的水体变清。
三、探讨性技术措施
1.超级堤坝
堤宽约在堤高的30倍以上，堤顶可建设交通道路及住宅、商业街等。由于堤身较宽，即使发生洪水漫溢也不致危及堤身安全。目前日本已在城市河段、沿海城市的诲塘推广超级堤坝建设。
2.利用河道滩地净化水质
对于一些小型城镇和村落，难以对生活污水全部通过污水处理厂进行处理，排入河道后将使水质恶化。在河道两岸滩区埋没大型污水处理槽，内填卵石，利用附着在卵石表面的细菌对污水中的有机物进行分解，污水经过生物处理后再排人河内，可明显地改善水质。
3.水系生态修复技术
发达国家正在努力弥补由于水利工程建设对生态系统造成的不利影响，采取各种生态修复技术：如增设过鱼通道，采用可供鱼类产卵和休息的护岸形式，修复天然弯道、浅滩，恢复湖周草场，恢复水系周边湿地等。
