面对取得的成绩和荣誉司定然并没有故步自封，而又把眼光集中到了更重要的课题，2002年他承担了中国医学科学院与英国牛津大学临床试验研究中心联合组织实施的协作研究项目——《中国第二项急性心肌梗塞临床治疗研究》及由加拿大、印度和中国共同发起的国际性协作研究《评价低分子肝素和代谢调节剂治疗急性心肌梗死临床研究》的部分研究工作，为两项大规模临床试验提供了一定的循证学依据，受到有关专家的一致好评。
在2000-2002的三年里，他带领的心内科取得了更加优异的成绩，医疗质量管理和精神文明建设保持双先单位，他也连续三年被评为院“优秀管理工作者”，“局劳动模范”，“局十佳青年”，2003年初被提拔为中原油田总医院业务副院长。
2003年的春天，非典型性肺炎肆虐中国大地，一场抗击非典的战争在全国打响，当和政府高度重视防治非典的这场战争。刚刚上任业务副院长的司定然同志在这危难之际自告奋勇地担起组织指挥抗击非典一线工作的重担，由于时间紧任务重，他连续七天吃住在工作现场，协调相关科室和部门，组织行政、后勤和医务人员，在不到一周的时间内，成功创建了发热门诊、非典病房，购置了防护服装和消杀物品，做好了防止非典的一切准备工作。在抗击非典最艰难、最危险的日子里，为了明确诊断几名非典疑似病例，司定然同志常常连续几天忙得回不了家，他不顾个人安危，一天奔波于非典病房和发热门诊之间数十趟，亲自给病人查体和询问病史，亲自为病人盛饭送水，亲自观察病情变化和治疗效果，在他的带领下，所有疑似病例均痊愈出院，整个油区没有一例非典感染病人，圆满完成了抗击非典的光荣任务，受到中原石油勘探局领导的高度赞扬和表彰。
作为业务副院长，他主管全院医疗和护理这两个决定医院生存和发展的重要部门，他深知自己身上担子的重量和责任，更加忘我地工作;他站在医院生存和发展的高度，对内基于医院工作的实际，对人员和岗位进行合理的分配，充分发挥全院医护人员的工作积极性，狠抓医护质量和服务水平，对外努力协调各方面的关系，为医院的发展创造良好的外部环境，由于他卓有成效的工作，目前，职工的工作热情空前高涨，医院的面貌焕然一新，医院的经济效益和社会效益日益提高。
司定然同志二十多年如一日，他那对技术精益求精的态度、对工作极端负责的作风、对患者无比热情的精神早已在当地广为流传，人们都夸他为优秀医生，学习楷模。
