11月3日，清华招办宣布，2009年入学的自主招生和保送生的笔试试卷将合一。
如果考生的综合卷成绩特别优秀，也可以不考虑前3科的基础科目考试成绩。
2009年，将不再区分自主招生和保送生试卷，考试一共4个科目，其中理工科为语文+英语、物理、数学和理科综合；文科为语文+英语、历史、数学和文科综合。
这4门科目将被分成两个部分，其中前3科为第一部分，综合卷为第二部分，内容既有别于高考，也不同于竞赛，“估计绝大多数考生在规定时间内无法完成”。
所有考生均应参加全部4科考试。前3科成绩优秀的考生，只要第4科达到基本线即可通过。
同样，如果第4科表现不错，前3科也只需要达到一个很低的基本线，甚至如果在第4科中表现特别优秀，可以不考虑前3科的成绩而直接通过。
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